Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPOP42166 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPOP42166 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms