Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF2P35227 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms