Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms