Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms