Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALB2P22676 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALB2P22676 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALB2P22676 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALB2P22676 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALB2P22676 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CALB2P22676 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CALB2P22676 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALB2P22676 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALB2P22676 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms