Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FGFR3P22607 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FGFR3P22607 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms