Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms