Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8BP10966 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8BP10966 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms