Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM228BP0C875 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM228BP0C875 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms