Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATE1O95260 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms