Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX4O95219 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX4O95219 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX4O95219 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX4O95219 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX4O95219 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX4O95219 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX4O95219 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX4O95219 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms