Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENRO43583 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENRO43583 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DENRO43583 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DENRO43583 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DENRO43583 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms