Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBAG9O00559 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms