Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BNH8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BNH8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BNH8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BNH8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BNH8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BNH8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms