Protein–RNA interactions for Protein: H3BN98

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BN98 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BN98 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BN98 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3BN98 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms