Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms