Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms