Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms