Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms