Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms