Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAN1Q9Y2M0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAN1Q9Y2M0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms