Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms