Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MID2Q9UJV3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms