Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APEX2Q9UBZ4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms