Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CC2D2AQ9P2K1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D2AQ9P2K1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms