Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHPF2Q9P2E5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms