Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK13-1Q9NX77 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms