Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEPPQ9NTK1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms