Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOMER3Q9NSC5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms