Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms