Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms