Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms