Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-5Q9HDB9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms