Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms