Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SEMA4CQ9C0C4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms