Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms