Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCP2Q9BX26 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms