Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms