Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NDFIP1Q9BT67 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms