Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT17Q9BSW7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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