Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS3Q9BQ31 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms