Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms