Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP88Q99567 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms