Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms