Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms