Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms