Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN2Q96NB2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms