Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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