Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIC2Q96JB3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms