Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms